.
DNS in vitro
Studiju kursa apraksts
Kursa apraksta statuss:Apstiprināts
Kursa apraksta versija:8.00
Kursa apraksta apstiprināšanas datums:31.08.2021 16:38:21
Par studiju kursu | |||||||||
Kursa kods: | BUMK_004 | LKI līmenis: | 7. līmenis | ||||||
Kredītpunkti: | 2.00 | ECTS: | 3.00 | ||||||
Zinātnes nozare: | Bioloģija; Ģenētika | Mērķauditorija: | Zobārstniecība | ||||||
Studiju kursa vadītājs | |||||||||
Kursa vadītājs: | Agnese Zariņa | ||||||||
Studiju kursa īstenotājs | |||||||||
Struktūrvienība: | Bioloģijas un mikrobioloģijas katedra | ||||||||
Struktūrvienības vadītājs: | |||||||||
Kontaktinformācija: | Rīga, Dzirciema iela 16, bmkrsu[pnkts]lv, +371 67061584 | ||||||||
Studiju kursa plānojums | |||||||||
Pilns laiks - 1. semestris | |||||||||
Lekcijas (skaits) | 2 | Lekciju ilgums (akadēmiskās stundas) | 2 | Kopā lekciju kontaktstundas | 4 | ||||
Nodarbības (skaits) | 14 | Nodarbību ilgums (akadēmiskās stundas) | 2 | Kopā nodarbību kontaktstundas | 28 | ||||
Kopā kontaktstundas | 32 | ||||||||
Studiju kursa apraksts | |||||||||
Priekšzināšanas: | Bioloģijā un ķīmijā (vidusskolas līmenī), pamatzināšanas molekulārajā bioloģijā. | ||||||||
Mērķis: | Veicināt zināšanu apguvi par mūsdienīgām DNS analīžu izmantošanas iespējām klīniskajā praksē. | ||||||||
Tēmu saraksts (pilna laika studijas) | |||||||||
Nr. | Tēma | Īstenošanas forma | Skaits | Norises vieta | |||||
1 | DNS molekulas noslēpumi. Ģenētiskā polimorfisma pētījumi un to nozīme slimību etioloģijas izpratnē. Ģenētikas loma praktiskajā zobārstniecībā. | Lekcijas | 1.00 | auditorija | |||||
2 | Iepazīšanas ar zinātniskās laboratorijas ierīcēm un darbu tajās. Individuāla eksperimenta plāna izstrāde. Pipetēšana. | Nodarbības | 1.00 | auditorija | |||||
3 | DNS izdalīšanai nepieciešamo šķīdumu sagatavošana. DNS izdalīšana, izdalītas DNS kvalitātes noteikšana. | Nodarbības | 1.00 | auditorija | |||||
4 | Polimerāzes ķēdes reakcija (PĶR). | Nodarbības | 1.00 | auditorija | |||||
5 | Horizontālās un vertikālās elektroforēzes pamatprincipi. PĶR produktu analīze agarozes gēlā. Restrikcijas fragmentu garuma polimorfisma analīze (RFLP). | Nodarbības | 1.00 | auditorija | |||||
6 | Poliakrilamīda gēla elektroforēze (PAAGE). | Nodarbības | 1.00 | auditorija | |||||
7 | Iegūto rezultātu validācija kā piemēra (parauga) metodi izmantojot sekvencēšanu. | Nodarbības | 1.00 | auditorija | |||||
8 | Mutes baktēriju uzsēšana DNS izdalīšanai. Paraugu izveide – kontroles grupa: DNS cilvēka (bez baktēriju piejaukuma). Baktēriju DNS pozitīvā un negatīvā kontrole. Reaģentu verifikācija. References laboratorijas. | Nodarbības | 1.00 | auditorija | |||||
9 | Praktiskajās nodarbībās iegūto rezultātu analīze. Ziņojumi par diagnostisko ģenētiskās testēšanas paraugu rezultātiem. | Nodarbības | 1.00 | auditorija | |||||
10 | Rezultātu apspriešana. Darba par baktēriju identificēšanu apspriešana; darba nozīme (periodontīta molekulārā Dg). | Nodarbības | 1.00 | auditorija | |||||
11 | Studentu portfolio prezentācijas. | Nodarbības | 1.00 | auditorija | |||||
12 | Periodontīta ģenētiskais aspekts. | Lekcijas | 1.00 | laboratorija | |||||
13 | DNS sekvencēšanas metodes. | Nodarbības | 1.00 | laboratorija | |||||
14 | DNS analizēšanas programmas. | Nodarbības | 1.00 | laboratorija | |||||
15 | DNS restrikcija un ligēšana. | Nodarbības | 1.00 | laboratorija | |||||
16 | Aktualitātes DNS pētniecībā. | Nodarbības | 1.00 | laboratorija | |||||
Vērtēšana | |||||||||
Patstāvīgais darbs: | Studiju kursa ietvaros tiek organizēts individuālais darbs ar jaunāko zinātnisko literatūru un literatūras apskata par konkrētu tematu iesniegšana kursa beigās. Pastāvīgais darbs sastāda 50% no gala vērtējuma. | ||||||||
Vērtēšanas kritēriji: | Tiks reģistrēta praktisko nodarbību apmeklēšana, kontrolēta laboratorijas protokolu izpildīšana, veikta iegūto iemaņu pārbaude. Kursa beigās ir iespējams iegūt kumulatīvo vērtējumu, ko veido aktivitātes praktiskajās nodarbībās un patstāvīgie darbi. | ||||||||
Gala pārbaudījums (pilna laika studijas): | Eksāmens (Rakstisks) | ||||||||
Gala pārbaudījums (nepilna laika studijas): | |||||||||
Studiju rezultāti | |||||||||
Zināšanas: | Studiju kursa apguves rezultātā studenti spēs raksturot ģenētiskās patoloģijas diagnostikas iespējas, izmantojot DNS analīzi. | ||||||||
Prasmes: | Pratīs izdalīt DNS no dzīvām šūnām, varēs veikt mutāciju analīzi, izmantojot elektroforēzi. Spēs izmantot DNS analīzes metodes skrīninga programmu izstrādāšanai. | ||||||||
Kompetences: | Studējošie, apvienojot teorētiskās zināšanas par ģenētiskās patoloģijas diagnostikas metodēm ar praktiskām iemaņām šo metožu izmantošanā, spēs novērtēt DNS diagnostikas nepieciešamību klīniskajā praksē. | ||||||||
Bibliogrāfija | |||||||||
Nr. | Atsauce | ||||||||
Obligātā literatūra | |||||||||
1 | Russell P.J. Genetics: A Molecular Approach. 3rd edition, Pearson, 2013. | ||||||||
2 | WS Klug, MR Cummings, ChA Spencer, MA Palladino, D Killian. Concepts of Genetics. Pearson, 12th ed., 2018. | ||||||||
Papildu literatūra | |||||||||
1 | Strachan T., Read A. Human Molecular Genetics. - GS, 2011 | ||||||||
Citi informācijas avoti | |||||||||
1 | Internets. NCBI (DNA &RNA, Genetics&Medicine, Genes &Expression, Genomes&Maps). Papildus saites tiks norādītas studiju kursa apguves laikā. |