14. aprīlī notiks Doktorantūras skolas rīkotais kārtējais vebinārs bioinformātikā, multiomikā un personalizētajā medicīnā.

3. vebinārs. Transcriptome & Proteome Data Analysis

In this lecture, we will first discuss the state-of-the-art bioinformatics analyses pipelines of transcriptome data, from quality control and filtering of the raw reads, to the alignments to the reference genome and the identification of differentially expressed genes. We will mainly focus on bulk RNA-seq data, however also single-cell RNA-seq analysis will be briefly discussed as well as specific challenges, when alternative splicing or particular classes of RNAs, such as microRNAs or long non-coding RNAs need to be analyzed. Finally, we will move to another omics discipline - proteomics - and discuss the bioinformatics analyses pipelines of proteome data.

Lektore

Dr. Baibai Vilnei ir vairāk nekā 10 gadu pieredze uz personalizēto medicīnu orientētajā bioinformātikā, analizējot genoma datu (čipus, VES / VGS), transkripcijas un mikrobioma datus. Viņas galvenais fokuss ir integratīvā multiomikas datu analīze, sākot no divu tipu datu integrācijas (piem., ekspresijas kvantitatīvo pazīmju lokusi; eKPL), kam seko gēnu koekspresijas tīklu / moduļu detekcija, saistot tos ar klīniskajiem, kā arī vides un dzīvesveida informāciju.

Baiba Vilne

Vadītāja, Vadošā pētniece

piedalīties vebinārā (zoom)

Nākamie vebināri šajā ciklā